流传于南台湾的宋江阵，源流虽已不可考，但因表演内容以拳术、器械为主，且指导武师都自称练的是“少林拳法”，因此一般认为宋江阵应源自少林拳术。

有关宋江阵的源流，历来众说纷纭。但明末清初南台湾已有宋江阵团练，如今嘉南平原以南仍有不少阵头，其中以高雄市内门区有全国最多的民俗艺阵阵头，达54个之多，是台湾民俗艺阵的国宝地区，单是宋江阵有18个阵头，堪称全国之最。

一般认为，宋江阵的训练与武馆有密切关系，指导者往往是武术馆的师傅，武师以所习的拳法，结合“水浒传”故事为蓝本进行团练，因此人数有“36天罡、72地煞”或108之数。

至于“宋江阵”的创立者，相传是少林五祖拳的祖师蔡玉川。早年地方上若有乱事，宋江阵武师即可指导团练乡勇执干戈以卫社稷，希望乡勇能除暴安良，伸张正义。

有民俗专家认为，宋江阵应是明末清初，漳、泉地区人士随郑成功来台，屯垦在台湾南部地区，兵勇利用农闲时练拳健身而流传至今。

清康熙年间，福建水师提督施琅攻台收复台湾，清廷怕沿海居民反清复明，严禁民间聚众练武；少林拳武师因而改头换面，以宋江阵的酬神娱人方式，暗中练武。

由于台湾庙宇香火鼎盛，早期的宋江阵也是农村子弟在农闲时学习武艺的场合，因此常依附寺庙，成为神佛驾前的艺阵。

虽然宋江阵发源于中国大陆，但大陆的宋江阵多已佚失，台湾则还保留大量且完整的阵式，其中最负盛名的高雄内门宋江阵更指导厦门宋江阵，使宋江阵得以发扬光大。